關於此實驗
逐代追蹤一個雙等位基因族群，並區分選擇、遷移和遺傳漂變的影響。檢視哈迪－溫伯格平衡下的基因型期望值，同時測試哪些過程會改變等位基因頻率。
學習目標
- 根據等位基因頻率計算預期的基因型比例。
- 說明基因型適合度如何改變其對繁殖的貢獻。
- 比較確定性的頻率變化與使用不同隨機種子的有限族群抽樣。
使用方法
- 1按照初始適合度值逐代推進。
- 2選擇中性繁殖，並驗證等位基因頻率保持不變。
- 3僅選擇遷移，並追蹤族群頻率向遷入者頻率靠近的過程。
- 4啟用遺傳漂變，比較不同隨機種子的結果，並測試適合度全部為零的繁殖族群。
模型
假設
- 每一步都會先按一定比例混入遷入者的等位基因，再計算隨機交配下的基因型期望值，最後套用相對存活適合度。
- 所選的 A 頻率會將 AA 中的兩個 A 拷貝都計入，並將 Aa 中的拷貝各計為一半。啟用有限族群遺傳漂變後，下一代會透過有放回抽樣，獨立抽取 2N 個基因拷貝。
- 此圖顯示的是下一次遷移事件發生前，根據目前等位基因頻率計算的基因型預期比例，而不是有限族群中觀察到的基因型數量。
- 模型中沒有突變，也沒有明確的年齡結構。相對適應度值皆為非負數；總適應度為零的繁殖族群不會產生後代。
- 繁殖失敗後，後續世代將維持未定義狀態。只有在設定的世代步驟中發生失敗之前，遷移才能補充缺少的可存活等位基因。
在課堂上試試這個實驗
- Q1為什麼中性的隨機交配會改變基因型比例，卻不改變等位基因頻率？
- Q2遷移能否引入一種之後會受到選擇青睞的等位基因？
常見問題
基因型圖表是否統計了實際採樣的個體？
不。圖表中的面積表示根據目前等位基因頻率計算的哈代－溫伯格平衡預期值。
為什麼軌跡會停止，而不是變為零？
平均繁殖適合度為零代表不存在子代族群。若將等位基因頻率設為零，就會錯誤地表示一個僅含 a 等位基因的族群仍然存活。