关于此实验
逐代追踪一个双等位基因群体，并区分选择、迁移和遗传漂变的影响。检查哈迪-温伯格平衡下的基因型期望值，同时测试哪些过程会改变等位基因频率。
学习目标
- 根据等位基因频率计算预期的基因型比例。
- 解释基因型适合度如何改变其对繁殖的贡献。
- 比较确定性的频率变化与使用不同随机种子的有限群体抽样。
使用方法
- 1按照初始适合度值逐代推进。
- 2选择中性繁殖，并验证等位基因频率保持不变。
- 3仅选择迁移，并追踪群体频率向迁入者频率靠近的过程。
- 4启用遗传漂变，比较不同随机种子的结果，并测试适合度全部为零的繁殖群体。
模型
假设
- 每一步都会先按一定比例混入迁入者的等位基因，再计算随机交配下的基因型期望值，最后应用相对存活适合度。
- 所选的 A 频率会将 AA 中的两个 A 拷贝都计入，并将 Aa 中的拷贝各计为一半。启用有限群体遗传漂变后，下一代会通过有放回抽样，独立抽取 2N 个基因拷贝。
- 该图显示的是下一次迁移事件发生前，基于当前等位基因频率计算的基因型预期比例，而不是有限群体中观测到的基因型数量。
- 模型中没有突变，也没有明确的年龄结构。相对适合度值均为非负数；总适合度为零的繁殖群体不会产生后代。
- 繁殖失败后，后续世代将保持未定义状态。只有在设定的世代步骤中发生失败之前，迁移才能补充缺失的可存活等位基因。
在课堂上试试这个实验
- Q1为什么中性的随机交配会改变基因型比例，却不改变等位基因频率？
- Q2迁移能否引入一种随后会受到选择青睐的等位基因？
常见问题
基因型图表是否统计了实际采样的个体？
不。图表中的面积表示根据当前等位基因频率计算的哈代-温伯格平衡预期值。
为什么轨迹会停止，而不是变为零？
平均繁殖适合度为零意味着不存在子代种群。若将等位基因频率设为零，就会错误地表示一个仅含 a 等位基因的种群仍然存活。