Français

Mutation génétique

LycéeBiologieSubstitution, insertion ou délétion dans une courte séquence codante, avec alignement explicite, décodage selon le code standard et comparaisons catégorielles des séquences

Débloquez ce laboratoire avec un pass

Un pass donne accès à toutes les simulations du site, y compris au mode Présentation pour les cours. Les ressources pédagogiques ci-dessous restent gratuites pour tout le monde.

Voir les passJ’ai déjà un pass

Paiement unique, sans abonnement.

À propos de cette expérience

Modifiez une position choisie de l’ADN et comparez la séquence exacte avant et après le changement. Les espaces dans l’alignement font apparaître les insertions et les délétions, tandis que le décodage des codons montre quelles séquences d’acides aminés changent. Les exemples prédéfinis distinguent les changements silencieux, les substitutions faux-sens, les codons stop prématurés et les décalages du cadre de lecture, sans prétendre prédire la fonction de la protéine.

Objectifs pédagogiques

  • Distinguez une substitution de base d’une insertion ou d’une délétion.
  • Reliez la longueur d’une insertion modulo trois à la préservation du cadre de lecture.
  • Comparez les catégories au niveau des séquences en tenant compte des limites de la recherche par codon.

Comment l’utiliser

  1. 1Appliquez l’exemple silencieux et comparez l’ADN modifié à la correspondance inchangée des acides aminés.
  2. 2Appliquez les exemples de mutation faux-sens et de codon stop prématuré, puis examinez les résidus modifiés et la position du codon stop.
  3. 3Insérez une base et comparez cette insertion à celle de trois bases.
  4. 4Choisissez une autre position de référence, appliquez une modification et consignez les deux séquences ainsi que sa catégorie.

Le modèle

Modification de la longueur de la séquence préservant le cadre de lecture
Modification de la longueur de la séquence décalant le cadre de lecture

Hypothèses

  • La référence est une courte séquence codante dépourvue d’introns. Le décodage s’effectue toujours dans le cadre de lecture 1, selon le code génétique standard, et s’arrête au premier codon stop dans ce cadre.
  • Les bases insérées répètent le symbole sélectionné. La suppression retire jusqu’au nombre sélectionné de bases disponibles. Les espaces n’apparaissent que dans l’alignement, pas dans la séquence utilisée pour le décodage.
  • Un codon de départ ATG original modifié est signalé séparément. Le décodeur ne modélise ni l’initiation, ni l’épissage, ni la stabilité de l’ARN, ni le repliement des protéines, ni leur activité, ni les effets à l’échelle de l’organisme. Les insertions ou délétions en phase peuvent également modifier des codons locaux ou des signaux stop.

À essayer en classe

  1. Q1Pourquoi une modification de l’ADN peut-elle laisser inchangée la séquence d’acides aminés décodée ?
  2. Q2Pourquoi l’ajout de trois bases préserve-t-il le cadre de lecture en aval, même si les codons voisins changent ?

Foire aux questions

Une modification synonyme est-elle garantie sans conséquence biologique ?

Non. Les acides aminés inchangés, traduits à partir des codons, ne tiennent pas compte de la régulation, de la maturation ni des autres effets dépendant de la séquence.

Un codon stop plus précoce signifie-t-il toujours que ce modèle prédit la protéine réelle ?

Non. Cela décrit une modification de la séquence dans le cadre de lecture, selon le décodeur indiqué, et non l’initiation ou l’expression réelles.