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Transcripción y traducción

Educación secundaria superiorBiologíaTranscripción de la cadena codificante y decodificación con el código genético estándar en un marco de lectura elegido, que se detiene en el primer codón de terminación dentro del marco

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Acerca de este experimento

Sigue la relación entre el ADN codificante, su molde complementario, un transcrito de ARN y un polipéptido. Transcribe una base cada vez y, después, permite que una ventana ribosómica procese codones completos. El marco elegido hace explícita la agrupación en tripletes, y un codón de terminación acaba la decodificación sin añadir un aminoácido.

Objetivos de aprendizaje

  • Distingue el ADN codificante del molde utilizado para la transcripción.
  • Agrupa un transcrito en tripletes dentro de un marco de lectura especificado.
  • Distingue una señal de terminación de un residuo de aminoácido.

Cómo usarlo

  1. 1Transcribe unas cuantas bases y compara el ARNm con el ADN codificante y el ADN molde.
  2. 2Completa la transcripción y luego descodifica los codones uno por uno mientras observas cómo crece la proteína.
  3. 3Llega al codón de terminación predeterminado y cuenta los aminoácidos por separado de los codones descodificados.
  4. 4Cambia el marco de lectura o aplica otra secuencia corta y compara los productos de la consulta.

El modelo

Correspondencia de transcripción de la cadena codificante
Posiciones de los tripletes en un marco de lectura seleccionado

Supuestos

  • La entrada es una secuencia de ADN codificante sin intrones, escrita en dirección 5′ a 3′. La hebra molde alineada es su complemento, escrito en dirección 3′ a 5′; el ARNm coincide con el ADN codificante, sustituyendo T por U.
  • Se utiliza el código genético estándar de la tabla 1 de NCBI. La consulta comienza en el marco seleccionado, sin buscar un codón de inicio. El primer UAA, UAG o UGA en el marco detiene la descodificación.
  • Los codones terminales incompletos no se traducen. Se excluyen el procesamiento del ARN, la maquinaria de iniciación, los códigos genéticos alternativos, el plegamiento de proteínas y la regulación de la expresión. La velocidad de operación es un control de visualización, no una predicción de la velocidad celular.

Pruébalo en clase

  1. Q1¿Por qué la secuencia de la hebra molde difiere del ARNm, mientras que el ADN codificante casi coincide con él?
  2. Q2¿Por qué cambiar el marco de lectura puede modificar todos los codones posteriores?

Preguntas frecuentes

¿Esto predice si una célula real expresa la secuencia introducida?

No. Determina la correspondencia de transcripción y consulta los codones, sin modelar la iniciación ni la regulación.

¿Por qué el codón de terminación aumenta el recuento de codones descodificados, pero no la longitud de la proteína?

Es una señal de liberación y no aporta ningún residuo de aminoácido.