關於此實驗
每次抽取一個基因複本,建立一代子代。比較 8 個可重現的族群,並探究繁殖族群大小如何影響隨機固定與喪失,同時不加入任何適應度優勢。
學習目標
- 區分隨機遺傳漂變與存活選擇。
- 了解二倍體族群大小與抽取的基因複本數量之間的關係。
- 認識到在沒有突變或遷移的情況下,固定與喪失是吸收狀態。
使用方法
- 1抽取一個基因複本,並檢查尚未填滿的子代容器。
- 2完成下一代,並將其頻率與親代進行比較。
- 3執行數個世代,並比較全部 8 條重複族群曲線。
- 4縮小繁殖族群,並使用新的隨機種子重新執行。
模型
假設
- 每個離散世代包含 N 個二倍體生物,以 2N 個基因拷貝表示。子代拷貝依據親代頻率進行有放回的獨立抽樣。
- 不存在選擇、突變或遷移。頻率為 0 或 1 時會維持不變。
- 初始 A 的數量取目標頻率乘以 2N 後最接近的整數。讀值顯示四捨五入後的實際初始頻率。
- 可以看到部分子代抽樣結果,但只有在抽取完全部 2N 個拷貝後,已完成世代的頻率才會更新。
- 每次重複都使用不同的決定性種子。相同的設定、種子和重複會精確重現相同的序列。珠子只是基因拷貝的象徵,並不代表空間中的生物個體。
在課堂上試試這個實驗
- Q1為什麼移除抽取過的親代珠子會導致模型錯誤?
- Q2在初始設定相同的情況下,一次重複中的頻率增加,而另一次重複中的頻率降低,這可能嗎?
常見問題
為什麼初始頻率有時會與目標頻率不同?
有限族群中,A 的複本數必須是整數。四捨五入至最接近的可用數量後,即得到報告的實際頻率。
為什麼部分抽樣期間的完成頻率保持不變?
只有抽取完全部 2N 個後代基因複本後,下一代才算完成。
