생물다양성 지수 시뮬레이션

이 실험 소개

5종으로 이루어진 군집을 편집하고, 모든 개체를 살펴본 뒤 재현 가능한 유한 표본을 추출합니다. 종 풍부도, 균등도, 샤논 다양도, 지니-심슨 다양도를 다양한 표본 크기에서 기대되는 종 풍부도와 비교합니다.

H = - i : p_{i} > 0 \sum p_{i} ln p_{i}

샤논 다양도는 종 풍부도와 상대적 풍부도를 반영합니다.

D = 1 - i \sum p_{i}^{2}

지니-심슨 지수는 독립적으로 두 개체를 뽑았을 때 서로 다른 종일 확률입니다.

E [S_{m}] = i \sum (1 - \frac{( m N - n _{i} )}{( m N )})

희박화 곡선은 비복원 추출을 통해 표본의 종 풍부도를 예측합니다.

같은 종의 개체는 모두 동등하게 취급됩니다. 표본은 편집된 군집 전체에서 비복원 균등 추출됩니다.
샤논 다양도에는 자연로그를 사용합니다. 여기서 지니-심슨 다양도는 군집 내 종별 비율의 제곱을 모두 더한 값에서 1을 뺀 것이며, 유한 표본에 대한 불편 보정값은 아닙니다.
희박화는 비복원 추출에서의 부재 확률을 사용해 표본에 포함되는 종 수의 정확한 기댓값을 계산합니다.
군집이 비어 있으면 종 풍부도는 0이고, 개체 수 가중 다양도는 정의되지 않습니다. 개체 수가 0인 종은 샤논 다양도에 기여하지 않습니다.
군집의 개체 수를 변경하면 이전 표본이 지워집니다. 계획된 표본 크기를 변경해도 표본은 다시 추출되지 않습니다. 종별 개체 수는 최대 100입니다. 우점종 프리셋에서는 우점종 비율을 80%로 유지하면서 편집할 수 있도록 총 개체 수를 최대 125로 제한합니다.

표본의 종 풍부도는 왜 곡선과 다른가요?

곡선은 가능한 무작위 표본들의 기댓값입니다. 윤곽선으로 표시된 개체들은 시드가 고정된 실제 표본을 나타냅니다.

비어 있는 군집에는 샤논 다양도를 0으로 지정하나요?

아니요. 종의 비율을 정의할 수 없으므로 인터페이스에는 해당 다양도 지수가 정의되지 않은 것으로 표시됩니다.