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Índice de biodiversidad

Educación secundaria superiorBiologíaMétricas exactas de diversidad de la comunidad y muestreo uniforme con semilla, sin reemplazo

Edita la abundancia de las especies, extrae una muestra real con una semilla fija y compara la riqueza observada con la expectativa de rarefacción. Haz clic en los individuos para eliminarlos de la comunidad.

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Se muestra la comunidad completa. Los individuos contorneados pertenecen a la última muestra uniforme sin reemplazo. Haz clic en un individuo para eliminarlo o usa los controles de las especies.

Cuaderno de mediciones

Cambia la configuración, comprueba una predicción y guarda el resultado. Se conservan hasta 12 instantáneas.

Acerca de este experimento

Edite una comunidad de cinco especies, examine cada individuo y tome una muestra finita reproducible. Compare la riqueza, la equidad, la diversidad de Shannon y la diversidad de Gini-Simpson con la riqueza esperada para distintos tamaños de muestra.

Objetivos de aprendizaje

  • Distinga la riqueza de la diversidad ponderada por abundancia.
  • Calcule los índices de Shannon y Gini-Simpson a partir de los recuentos de especies.
  • Compare una muestra observada con su expectativa exacta de rarefacción.

Cómo usarlo

  1. 1Tome una muestra de la comunidad y examine qué individuos se seleccionaron realmente.
  2. 2Cambie el tamaño de muestra previsto y confirme que la muestra anterior permanece fija.
  3. 3Compare una comunidad equitativa con otra dominada por una especie.
  4. 4Elimina una especie, luego vacía la comunidad y comprueba qué métricas pasan a estar indefinidas.

El modelo

La diversidad de Shannon pondera la riqueza y la abundancia relativa.
El índice de Gini-Simpson indica la probabilidad de que dos extracciones independientes de una comunidad difieran en cuanto a las especies.
La rarefacción predice la riqueza de especies de una muestra sin reemplazo.

Supuestos

  • Todos los individuos de una especie son equivalentes. Las muestras se extraen de forma uniforme y sin reemplazo de la comunidad editada completa.
  • Shannon utiliza logaritmos naturales. Aquí, Gini-Simpson significa 1 menos la suma de las proporciones de la comunidad al cuadrado, no su corrección insesgada para muestras finitas.
  • La rarefacción calcula el número esperado exacto de especies representadas mediante las probabilidades de ausencia al muestrear sin reemplazo.
  • Una comunidad vacía tiene una riqueza de cero y una diversidad ponderada por abundancia indefinida. Las especies con un recuento de cero no contribuyen a la diversidad de Shannon.
  • Al cambiar los recuentos de la comunidad, se borra la muestra anterior. Cambiar el tamaño de muestra previsto no vuelve a extraerla. El recuento de cada especie está limitado a 100; el ajuste preestablecido de especie dominante limita el total a 125 para que se pueda editar una especie dominante del 80 por ciento.

Pruébalo en clase

  1. Q1¿Pueden dos comunidades tener la misma riqueza, pero una diversidad de Shannon diferente?
  2. Q2¿Por qué puede una muestra no incluir una especie que existe en la comunidad completa?

Preguntas frecuentes

¿Por qué difiere la riqueza de especies de la muestra de la curva?

La curva representa la expectativa sobre las posibles muestras aleatorias. Los individuos resaltados muestran una muestra real obtenida con una semilla concreta.

¿Se asigna una diversidad de Shannon igual a cero a una comunidad vacía?

No. Las proporciones de sus especies no están definidas, por lo que la interfaz indica que ese índice de diversidad no está definido.