Acerca de este experimento
Construya una hélice a partir de una secuencia corta de ADN, examine pares de bases individuales y separe las hebras. La secuencia determina el contenido de GC y el recuento idealizado de enlaces de hidrógeno, mientras que el giro geométrico controla la representación de la hélice. La hebra complementaria se muestra en la dirección química opuesta.
Objetivos de aprendizaje
- Empareje A con T y C con G en hebras antiparalelas.
- Relacione el contenido de GC con un recuento sencillo de enlaces de hidrógeno.
- Distinga los parámetros geométricos de la hélice de un cálculo de energía molecular.
Cómo usarlo
- 1Seleccione varios pares de bases en tres dimensiones y compare sus parejas.
- 2Aplique otra secuencia de seis a veinticuatro bases y examine su complemento.
- 3Desenrolle la hélice y compare los recuentos de pares de bases y de enlaces.
- 4Cambie el número de pares de bases por vuelta y, después, anote la longitud del contorno y el contenido de GC.
El modelo
Supuestos
- La secuencia describe una hebra de 5′ a 3′; la hebra complementaria alineada va de 3′ a 5′. Solo se aceptan bases de ADN estándar.
- El ascenso axial está fijado en 0,34 nm por par de bases. El giro es un control geométrico respecto a una referencia de ADN-B de aproximadamente 10,5 pares por vuelta.
- Los pares A-T cuentan como dos puentes de hidrógeno y los G-C como tres. Este recuento no es un modelo de energía de unión ni de temperatura de fusión; excluye el apilamiento y las condiciones del disolvente y los iones.
Pruébalo en clase
- Q1¿Por qué deben tener etiquetas de extremos opuestas las etiquetas complementarias que se muestran?
- Q2¿Por qué el recuento de puentes de hidrógeno por sí solo no basta para predecir la temperatura de fusión?
Preguntas frecuentes
¿Cambiar el giro simula el superenrollamiento del ADN?
No. Vuelve a dibujar una hélice con una repetición angular elegida, sin resolver la elasticidad ni la topología.
¿El desenrollamiento elimina nucleótidos?
No. Separa las bases complementarias y conserva ambas cadenas parentales.