인터랙티브 계통수 시뮬레이션

이 실험 소개

장식적인 유사성 도표가 아니라 공유 형질을 바탕으로 계통수 가설을 세웁니다. 6개의 이진 형질을 편집하고, 세 가지 무근 사분기 계통수의 정확한 비용을 모두 비교하며, 계통 관계를 바꾸지 않고 표시된 가지를 회전합니다.

L (T) = j = 1 \sum 6 min (state changes for trait j)

각 토폴로지에는 이진 형질 변화 횟수의 가능한 최소 총합이 부여됩니다.

T_{b es t} = {T : L (T) = U min L (U)}

근거 없는 확실성을 암시하지 않도록 동률인 결과를 모두 유지합니다.

분류군 A부터 D까지 네 개에는 완전한 이진 형질이 여섯 개 있습니다. 형질의 순서는 중요하지 않으며 모든 상태 변화의 비용은 같습니다.
모델은 가능한 세 가지 무근 사분할계통수 토폴로지 모두에 피치 집합의 교집합 및 합집합 규칙을 적용하고, 형질별 최소 변화 횟수를 합산합니다.
동일하게 가장 간명한 모든 계통수는 식별된 상태로 유지됩니다. 비교를 위해 선택된 계통수보다 비용이 높은 대안을 선택할 수도 있습니다.
그림에서는 표시를 위한 임의의 루트와 동일한 레이아웃 깊이를 사용합니다. 루트의 방향, 시간 또는 가지 길이는 추론하지 않습니다.
간명성은 단순화된 추론 기준입니다. 수렴, 역전, 서로 다른 진화 속도, 불확실한 형질 코딩으로 인해 실제 조상 관계가 가장 적합한 가설과 다를 수 있습니다.

가지가 길수록 더 오래되었거나 더 많이 다른가요?

아니요. 가지 길이와 표시된 뿌리는 이 다이어그램의 배치만 정합니다. 이 모델은 뿌리가 없는 관계와 형질의 비용을 비교합니다.

선호되는 계통수가 조상 관계를 증명하나요?

아니요. 이는 선택한 형질과 비용이 동일하다는 가정 아래 변화가 가장 적은 가설이며, 추가 증거에 따라 반박될 수 있습니다.