Acerca de este experimento
Construye una hipótesis de árbol a partir de rasgos compartidos, en lugar de un diagrama decorativo de similitud. Edita seis caracteres binarios, compara los costes exactos de los tres árboles cuarteto no enraizados y rota las ramas mostradas sin cambiar las relaciones.
Objetivos de aprendizaje
- Distingue entre una matriz de rasgos compartidos y una hipótesis de árbol.
- Compara el número mínimo de cambios de rasgos de las topologías alternativas.
- Reconoce los empates sin resolver y las rotaciones de ramas equivalentes.
Cómo usarlo
- 1Examina la matriz inicial y compara las puntuaciones de las tres topologías.
- 2Cambia el rasgo de un taxón y observa qué topología resulta más parsimoniosa.
- 3Borra todas las diferencias e identifica el empate triple sin resolver.
- 4Selecciona y gira un agrupamiento interno; después, verifica que sus taxones y puntuación sigan siendo los mismos.
El modelo
Supuestos
- Cuatro taxones, de A a D, tienen seis caracteres binarios completos. El orden de los caracteres es irrelevante y cada cambio de estado tiene el mismo coste.
- El modelo aplica las reglas de intersección y unión de Fitch a las tres topologías de cuartetos no enraizadas posibles y suma los cambios mínimos de todos los rasgos.
- Se mantienen identificados todos los árboles igualmente parsimoniosos. El árbol seleccionado también puede ser una alternativa de mayor coste para comparar.
- La representación utiliza una raíz de visualización arbitraria y profundidades de disposición iguales. No infiere la dirección de la raíz, el tiempo ni las longitudes de las ramas.
- La parsimonia es un criterio de inferencia simplificado. La convergencia, las reversiones, las tasas desiguales y la codificación incierta de los caracteres pueden hacer que la ascendencia histórica difiera de la hipótesis preferida.
Pruébalo en clase
- Q1¿Por qué las filas de rasgos idénticas no permiten determinar un árbol único?
- Q2¿Por qué girar un grupo interno conserva la relación entre los árboles?
Preguntas frecuentes
¿Las ramas largas son más antiguas o más diferentes?
No. Las longitudes de las ramas y la raíz mostrada solo organizan este diagrama. El modelo compara relaciones no enraizadas y costes de los caracteres.
¿Demuestra el árbol preferido la ascendencia?
No. Es la hipótesis que requiere menos cambios según los rasgos elegidos y el supuesto de que todos tienen el mismo coste; puede cuestionarse con pruebas adicionales.